Le dispositif de pilotage du programme comprend :
- Un Conseil d’orientation stratégique qui est l’organe de pilotage stratégique du programme ;
- Un Comité de supervision qui a pour mission d’assurer le suivi opérationnel de l’ensemble du programme;
- Le dispositif régional de suivi bâti autour du Cadre de concertation régionale (CCR) pour assurer le suivi de proximité.
La coordination du programme est assurée par une Unité de Coordination du PUS-BF chargée essentiellement de la bonne coordination et du suivi-évaluation de la mise en œuvre des activités du programme. Outre le Coordonnateur, l’Unité de de coordination est composée : d’un coordonnateur délégué, d’un chargé de projet, de chargés de composante, de spécialistes en Suivi et Évaluation, d’un/une responsable administratif et financier, d’un chargé de communication et de personnel d’appui.